L’exposition se divise en deux grandes sections. Dans la section est sont exposés les objets datant du Néolithique récent et de l’Âge de bronze (époque minoenne). Dans la section ouest sont exposés les antiquités datant de l’Âge du fer (époque historique). Les objets sont regroupés par site de fouilles et par thème. Les collections comprennent des objets minoens provenant de la ville de Chania, des pièces préhistoriques trouvées dans des grottes, des découvertes minoennes de diverses régions du département, des objets provenant de tombes de l’époque géométrique, des objets de la période historique découverts à Chania et dans d’autres villes du département, des pièces de monnaie, des bijoux (des périodes préhistorique et historique), des sculptures, des inscriptions, des stèles, des mosaïques.
En 2000, Konstantinos, Marika et Kyriakos Mitsotakis ont fait don au musée de leur intéressante collection. Celle-ci occupe trois petites salles au nord, à côté de l’église d’Agios Frangiskos (Saint-François). Les pièces exposées représentent le tiers de la collection et leur présentation suit un ordre chronologique (de la fin du IVe millénaire av. J.-C. au IIIe s. ap. J.-C.). Elles comprennent des céramiques minoennes, des poteries, des sculptures sur pierre, des sceaux, des bijoux et des varia (objets divers provenant de différents sites).
Le musée possède des ateliers de conservation pour les poteries, les objets en métal, les pièces de monnaie, les fresques et les mosaïques, ainsi qu’un laboratoire de chimie. Il existe également une boutique du Fonds de ressources archéologiques dans un clocher spécialement aménagé à proximité de l’entrée principale.
Le musée a pour but de promouvoir l’histoire culturelle de la région de la meilleure façon possible, de sorte à attirer de nombreux visiteurs. C’est dans ce contexte que le musée organise des expositions temporaires, des programmes éducatifs et autres évènements culturels. Vanna Niniou – Kindeli, Aggeliki Tsigou, archéologues)
Heures d’ouverture: Mar-Ven de 08,00 à 19,00, sam-dim 08,30 à 15,00, lun fermé.